Mulder kommt ins San Diego County Children's Center, wo Scully sich um Emily kümmert. Sie erzählt ihm, sie benötige einen Zeugen der für sie in dem Adoptionsverfahren aussagt. Mulder informiert sie wiederum über Frohikes Versuch sich in den Computer der kalifornischen Sozialbehörde einzuloggen und dort die Adoptionsdatenbank durchzusehen. Dort ist als Mutter von Emily der Name Anna Fugazzi eingetragen, eine gebräuchliche Bezeichnung für einen nicht vorhandenen Namen. Er warnt Scully die Leute hinter dieser Verschwörung würden alles tun um zu verhindern, daß Scully Emily bekommt. Bei der Anhörung im Adoptionsverfahren zeigt Mulder eine Akte, die Scullys Abwesenheit vor ein paar Jahren dokumentiert. Er behauptet Emily Sim wurde durch ein wissenschaftliches Experiment gezeugt, doch davon abgesehen wäre Scully Emilys Mutter.

Scully erhält später wieder eine mysteriösen Anruf. Eine Rückverfolgung ergibt als Anrufer jemanden aus dem County Children's Center. Als die Agenten dort eintreffen entdecken sie eine faserige Zyste an Emilys Nacken. Als ein Arzt eine Probe für eine Biopsie von der Zyste entfernt tritt eine grüne Flüssigkeit aus, daraus treten Gase aus, die der Arzt einatmet. Er muß daraufhin im Krankenhaus behandelt werden. Danach verweigert Dr. Calderon es die Krankenakte von Emily an das Children's Center zu leiten, aber Mulder zwingt ihn daraufhin ziemlich aufgebracht und gewaltsam dazu.

Später trifft Calderon zwei dunkel gekleidete Männer am Dimsdale Altersheim. Als sie bemerken, daß Mulder Calderon gefolgt ist töten sie Calderon mit einer außerirdischen Waffe und nehmen dann seine Gestalt an. Einer der beiden "Dr. Calderons" fährt daraufhin zum Children's Center und injiziert Emily eine grüne Flüssigkeit. Die etwas überraschte Scully verfolgt "Calderon" daraufhin durch das Krankenhaus, doch als sie ihn fast erreicht verändert er wieder seine Gestalt in einen völlig Fremden. Als Mulder und Scully danach telefonieren, vermutet Mulder die Flüssigkeit wäre nicht gefährlich für Emily, da offenbar jemand Emily lebend haben will, aus welchem Grund auch immer.

Mulder geht in der Zwischenzeit ins Dimsdale Altersheim. Dort bemerkt er, daß die älteren dort wohnenden Frauen Hormoninjektionen bekommen, darunter auch eine Anna Fugazzi. Und Frohike entdeckt, daß die Frauen alle erst vor ein paar Jahren Kinder bekommen haben.

Emily wird weiterhin einer Therapie und medizinischer Untersuchungen unterzogen, doch ihr Zustand verschlechtert sich immmer weiter. Daraufhin muß sie in eine Druckkammer gebracht werden. Plötzlich bewegt sich eine schlangenartige Kreatur unter ihrer Haut.

Mulder entdeckt Zylinder die lebende, menschliche Embryos in einer grünen Flüssigkeit enthalten. Er entnimmt drei Ampullen der Flüssigkeit und geht wieder auf den Flur. Dort taucht plötzlich Detective Kresge auf und hält Mulder eine Waffe an den Kopf. Dann nimmt er ihm die Ampullen aus der Hand. In diesem Moment erscheint einer der "Calderons" am Ende des Flurs, Mulder nutzt die Gelegenheit eine der Ampullen zu greifen und wegzulaufen. Beim Laufen warnt er Kresge noch nicht auf den "Calderon" zu schießen, doch der schießt trotzdem, und wird von den aus dem Alienkörper austretenden Gasen überwältigt. Der Alien nimmt daraufhin Kresges Gestalt an und verschwindet aus dem Gebäude.

Emily fällt ins Koma und stirbt kurze Zeit später. Bei der Beerdigung erzählt Scully Mulder, daß es noch Beweise gibt für das was die Männer Emily angetan haben. Doch als sie den Sargdeckel öffnet entdeckt sie dort nur mehrere kleine Sandsäcke, einer hat sich geöffnet und den Sand auf dem Boden verteilt. Im Sand entdeckt sie ihr goldenes Kreuz, welches sie Emily gab.