In einer abgelegen Kolonie für Leprakranke in West Virginia müssen Insassen aus einem Versteck aus beobachten, wie Mitpatienten von einem Todesschwadron erst zusammengetrieben und danach systematisch erschossen werden. Unterdessen sucht Mulder in einem Schnellzug nach einem japanischen Professor, der für die Verladung eines mysteriösen Wesens in einen Quarantänewaggon verantwortlich ist - ein Doktor von dem Scully aufgrund von Photographien sagt, er sei bei ihrer Entführung anwesend gewesen. Als Mulder den Mann tot im Badezimmer auffindet, macht er sich auf die Suche nach dem Mörder, der sich immer noch im Zug ist. Scully stellt eine Verbindung zwischen dem Arzt und der Kolonie fest und erhält Informationen über medizinische Menschenversuche, die bis zum 2. Weltkrieg zurückreichen. Mulders Glaube an außerirdische Hybridisationsexperimente steht Scully´s Überzeugung gegenüber, daß es sich um exzessive medizische Greueltaten handelt. Nur Scullys Erinnerungen und kryptische Mitteilungen von X können Mulder retten, der sich in einem versiegelten Zugwaggon in der Falle befindet - zusammen mit einer Bombe, einem kaltblütigen Killer und einem Wesen das ein menschlicher/ausserirdischer Hybrid ist, oder auch nicht.